MySQL中的IO问题分析与优化

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在业务迭代中,随着数据量的上升,会出现慢SQL情况,但是当我们去分析单条SQL的时候,发现其执行速度并没有那么慢,原因是什么呢,那么就可能是RDS服务器IO产生了瓶颈。

日常,我们可以通过 IOPS(Input/Output Per Second) 指标来衡量 IO 是否处于健康的范围。我们使用的阿里云 RDS 通常根据不同的规格做了不同的 IOPS 限制。如果短时间内频繁的操作,不管是 SELECT 带来的读磁盘操作,还是 INSERT、UPDATE、DELETE 带来的写磁盘操作,均可能会触发最大 IOPS 限制。本文将从实际业务分析,探讨根据 IOPS、Redo 写次数等指标定位 IO 触发瓶颈的原因,如何优化。

一、业务背景

活动 MySQL 规格:4C,最大连接数 2500,最大 IOPS 4500。

早上 10 点,是活动业务 QPS 最高的时候,因为这时候通常会释放奖品库存。有段时间,监控爆出了慢 SQL 的问题,但是通过监控指标观测 QPS 的时候,并没有到达预想中的峰值,但是读写RT会出现一些突刺。再进而查看 IOPS 指标,我们发现异常得高,如下图:

阿里云 RDS 中 MySQL 的 IOPS 指标

阿里云 RDS 机器的 IOPS 指标

你可能会发现 RDS 实例最大限制不是 4500 吗?为何这里已经达到了 11000 以上了呢?起初我理解的是 MySQL 统计 IOPS,大部分操作都命中了缓冲区,限制的磁盘 IOPS。后面也咨询了 DBA,说是 IOPS 其实没办法准确限制。这到底是什么情况?我们接着往后看。

这时候会统计出来一些查询类的慢 SQL,我们优先去分析这些 SQL 的执行计划,发现其走了索引,也会回表,扫描的行数比较大:

同期慢 SQL 统计

产生慢 SQL 的表,是一张业务明细表,每个用户平均每天产生的数据量约 20 条,假如日活 5w 的话,每天的增量 100w,半年产生的数据约 2 个亿,该业务已持续运营 一年以上。那么面对这样的场景,我们该如何定位原因、如何动手优化呢?

二、分析方法

各个业务线有很多预警、告警,很容易监控到 RDS 运行异常问题。当我们拿到异常的时候,首先肯定是通过监控图表观测技术指标,确定影响范围,设计止血方案,然后才是定位问题,解决问题。

相对来说,IOPS 过高等告警都是短暂性的,一般发生在业务高峰期。这种情况经常是渐变产生的,随着业务增长,数据量也在增长,表结构也越来越复杂,一些早期的 SQL 在索引选择上发生了变化,取得目标数据扫描的行数越来越多。

1. MySQL 指标

上面的业务背景中数据库 QPS 峰值 1 w,TPS峰值 2.5 k。下面结合这个前提来分析 MySQL 的运行指标。除了上面提到的 IOPS 指标,Buffer pool 请求次数、Redo 写次数等数据指标,这些健康指标协同起来看,会发现该时段真实产生的读、写操作都比较频繁。

其中 innodb_rows_read 已经达到 22w 以上,innodb_rows_updated 达到 1w 以上,相对来说读操作被放大了 22 倍,写操作被放大了 4 倍。

(1) Redo 写次数

(2) Row Operations

(3) Buffer Pool 请求次数

(4) 慢 SQL

(5) 其他指标

如果 MySQL 在 IO 方面出现了阻塞的现象,也可以观察以下几个指标:

参数名 意义 备注
Innodb_data_pending_fsyncs 当前阻塞的 fsync 操作 一般为 0,比较高的话,看一下 innodb_flush_method 的设置
Innodb_data_pending_reads 当前阻塞的 read 操作 一般为 0,如果指标较高且影响业务的话,参考读压力的应对方式
Innodb_data_pending_writes 当前阻塞的 write 操作 一般为 0,如果指标较高且影响业务的话,参考写压力的应对方式
Innodb_os_log_pending_fsyncs 写redo log 时,当前阻塞的 fsync 操作 一般为 0,如果大于 0 的话,通常就是 IO 设备的瓶颈,考虑把 redo log 迁移到 SSD 或者做 IO 隔离,独占 IO 设备的性能
Innodb_os_log_pending_writes 写redo log 时,当前阻塞的 write 操作 一般为 0,如果指标较高且影响业务的话,参考写压力的应对方式

这些指标阿里云未在健康图表上给出,应该是觉得目前的图表已经够用了。这些指标可通过登录 RDS 执行 show global status like '%innodb%read%' 查看,但是这类指标一般是累计值,需要对比上一个取值时间的差值才能有比较实际的作用,通常也是用来判断 MySQL 的读写比例用,结合上表的 pending 数据和其他的系统指标来综合判断 IO 系统的负载。

2. 机器I/O分析

一般情况,业务开发无法直接或者间接访问 RDS 机器的,经常由 DBA 统一管理。这里,我们可以了解一下 Linux下I/O 分析工具。

(1) iostat

iostat -x

关于 CPU 的指标,我们重点看 %iowait 和 %idle 两个指标。

  1. %iowait:CPU 等待输入输出完成时间的百分比;
  2. %idle:CPU 空闲时间百分比。

若%iowait 的值过高,则表示硬盘存在 I/O 瓶颈;若 %idle 值高,表示 CPU 较空闲。如果 %idle 值高但系统响应慢时,有可能是 CPU 等待分配内存,此时应加大内存容量。%idle 值如果持续低于 10,那么系统的 CPU 处理能力相对较低,表明系统中最需要解决的资源是 CPU。

关于 Disk 指标,我们重点看 %utils、svctm、await 和 avgque-sz几个指标。

  1. avgqu-sz: 平均 I/O 队列长度;
  2. await: 平均每次设备 I/O 操作的等待时间 (毫秒);
  3. svctm: 平均每次设备 I/O 操作的服务时间 (毫秒);
  4. %util: 一秒中有百分之多少的时间用于 I/O 操作,即被 I/O 消耗的 CPU 百分比

若 %util 接近 100%,说明产生的 I/O 请求太多,I/O 系统已经满负荷,该磁盘可能存在瓶颈;若 svctm 比较接近 await,说明 I/O 几乎不需要等待;若 await 远大于 svctm,说明 I/O 队列太长,I/O 响应太慢,则需要进行必要优化;若 avgqu-sz 比较大,也表示有大量 IO 在等待。

(2) iotop

iotop -oP

通过输出结果,我们可以清晰地了解当前哪些进程在读写磁盘,以及读写速率和 IO 使用占比。

综上,通过 MySQL 指标及机器运行指标分析当前 MySQL 的 IO 健康状态,以及 IO 负载过高时的慢 SQL,我们再从慢 SQL 来分析其执行计划,从而根据具体业务场景来制定优化方案。

三、解决方案

当我们业务中遇到IO问题时,我们可以从以下几个方面考虑:SQL优化、配置优化、存储优化和硬件升级优化。

1. 硬件升级

硬件升级,可以说是解决常规性能问题的最有效且快速的方法。不管代码层面、 SQL 层面是多么低效,高配或者超配的硬件规格都能规避性能问题。在一些线上紧急问题处理场景中,不失为一种最优的快速止血方案。

比如上述的业务背景,IOPS 触发了机器的限制,那么我们将RDS升配至中等配置,IOPS 上限提高到 9000,便可以快速解决。问题是是否真的紧急和必要,其实 90% 业务场景的紧急程度并没有那么高,硬件升级也不是最合适的方案。

2. 存储优化

我一般将存储优化理解成分库分表、数据归档两个方面。何时进行数据归档,何时进行分库分表,也是老生常谈的问题。

那么做了以上两个优化后,对 IO 的正向影响就是减少了数据量,一些慢 SQL 扫描的行数自然下降。

3. SQL优化

SQL 优化又分为两个方向,既有索引下 SQL 语句的优化和索引调整层面的优化。根据具体业务场景及数据调整索引策略,这个方面没什么好说的,尽可能使得扫描的行数降低。

4. 配置优化

针对读操作场景,我们可以使用 innodb_buffer_pool_size 来减少 I/O 负载。

我们可以通过此参数指定缓冲池的大小。如果缓冲池很小并且有足够的内存,那么通过减少查询访问InnoDB表所需的磁盘 I/O 量可以提高缓冲池的性能,从而提高性能。innodb_buffer_pool_size 选项是动态的,允许在不重新启动服务器的情况下配置缓冲池大小。

#设置大小
set global innodb_buffer_pool_size = 26843545600

针对写操作频繁的场景,我们可以利用 undo/redo log 和 binlog 的写入磁盘机制,来分析和配置这些参数:

此项配置用来针对 undo/redo log 的磁盘写入配置。有3个取值:

如果我们可以在数据库服务器宕机的时候,允许有 1 秒的数据丢失,其实用设置为 2 是最优的方案,可以提高性能。

#查看当前配置
show variables like 'innodb_flush_log_at_trx_commit'; 
#设置生效
set global innodb_flush_log_at_trx_commit=2;

此项配置用来针对 binlog 的磁盘写入配置,可以用来配置合并多少条 binlog 一次性写入磁盘。

针对sync_binlog,同样允许数据库服务器宕机的情况下能接受丢失N条数据的, 可以配置为N,能提高性能。

#查看当前配置
show variables like 'sync_binlog'; 
#设置生效
set global sync_binlog=100;

四、总结

最后简单总结一下 IO 问题分析,上面主要分析的是我们现在的活动业务,也就是随机读写频繁的场景,这时候 IOPS 是最为关键的衡量指标。另一个重要指标是数据吞吐量 (Throughput),指单位时间内可以成功传输的数据数量。对于大量顺序读写的应用,我们可以关注吞吐量指标。

通常我们可以通过硬件升级、SQL 优化、表结构优化、分库分表、数据归档等方向去做优化策略,适当地采用一种或几种协同是比较好的解决方案。

参考目录

1 . https://developer.aliyun.com/article/603735

2 . https://www.modb.pro/db/45779

3 . https://cloud.tencent.com/developer/article/1748024

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