德国NMR网络正在加速全球SARS-CoV-2病毒蛋白相关研究

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站在核磁共振(NMR)光谱仪上的 Martin Hengesbach 和 Andreas Schlundt

SCI Tech Daily 报道称,位于德国法兰克福歌德大学的祖尔格实验室,已经汇集了来自全球 17 个国家或地区的研究网络的 80% 的 SARS-CoV-2 蛋白信息。

其旨在使用核磁共振波谱(NMR)来描述 SARS-CoV-2 分子的三维结构。首先是利用特殊的同位素原子来标记分子,然后将之暴露于强磁场中。然后借助 NMR 来高效、仔细地查看潜在的活性化合物是如何与病毒蛋白结合的。

上述操作是在该校生物分子磁共振中心(BMRZ)和其它地点完成的,但研究的前提,还需要为相关测试准备大量具有高纯度和稳定性的蛋白质、并以正确的方式对其进行折叠。

据悉,这一遍布全球的研究网络,由歌德大学有机化学与化学生物学研究所的 Harald Schwalbe 教授负责协调。而制定用于生产蛋白质的实验室规程,也已经抵达了第二个里程碑。

除了蛋白质,科学家们还对 SARS-CoV-2 病毒的 RNA 链展开了深入调查。去年的时候,研究团队已经对其所有重要的 RNA 片段提供了访问。

凭借 129 名同事的专业知识,现其已能够完全实现“试管”操作,大量生产及纯化 SARS-CoV-2 近 30 种蛋白质中的 23 种。

通过将这些蛋白质的遗传信息整合到环状的小 DNA 片段(质粒)中并植于细菌体上,就可以产出所需的蛋白质。

在分离并富集了由无细胞系统产生的一些特殊蛋白质后,研究人员便可通过 NMR 光谱来评估其是否仍能够正确折叠。

歌德大学有机化学与化学生物学研究所的 Martin Hengesbach 博士解释称:

我们已经分离出了 SARS-CoV-2 蛋白的功能单元,从而了解其表征结构、功能和相互作用。

当然,这离不开大型财团的援助,以便让世界各地的实验室都能够对 SARS-CoV-2 蛋白及随后的突变体开展快速、可重复的工作。

从一开始,他们就意识到这是最优先的事项。所以除了制定相关协议,我们还免费提供了质粒。

歌德大学分子生物科学研究所的 Andreas Schlundt 博士补充道:

我们正在加速全球范围内的 SARS-CoV-2 相关研究,因为其它科学实验室不必再耗费数月时间来打造和优化用于 SARS-CoV-2 蛋白生产及研究的配套平台。

得益于我们精心设计的方案,大家已能够在两周内开展相关研究工作。鉴于近期爆发了众多的 SARS-CoV-2 突变,能够快速获取的可靠且完善解决方案,对病毒研究人员也变得尤为重要。

与此同时,NMR 联盟也没有停下相关工作的脚步,目前研究人员正在努力检索病毒蛋白是否能够与潜在的药物相结合。

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